Novel phylogenetic data is used to show that the poorly-known species Begonia glandulifera and Begonia mariannensis form a clade with Begonia buddleiifolia, the type species of Begonia section Pilderia. A unique combination of characters is identified in this group and used to re-circumscribe the section to include these species, and two morphologically similar species: Begonia jenmanii, and Begonia humilliana. A new species is described herein as Begonia tepuiensis sp. nov. from a single tepui in the Amazonas State of Venezuela. A full taxonomic revision and key to the species of Begonia section Pilderia is presented and we assign all species to IUCN Red List categories.ResumenSe usaron nuevos datos filogenéticos para mostrar que las especies pobremente conocidas: Begonia glandulifera y Begonia mariannensis forman un clado con Begonia buddleiifolia, la especie tipo de Begonia sección Pilderia. Se identificaron una combinación única de caracteres en este grupo, que fueron usados para re-circunscribir la sección incluyendo estas especies, y dos especies morfológicamente similares: Begonia jenmanii y Begonia humilliana. Se describe una nueva especie, Begonia tepuiensis sp. nov. de un tepui en el estado Amazonas de Venezuela. Se presenta también una revisión taxonómica completa y una clave para las especies de Begonia sección Pilderia y asignamos todas las especies a categorías de la Lista Roja de la UICN.