Los niños ingresan en el Sistema Educativo con diferentes experiencias escolares, alcanzando también diferentes niveles de aprendizaje y resultados escolares. En este estudio, nuestra pretensión es comprender el impacto de la familia y de la escuela en el desempeño cognitivo y el rendimiento académico de los niños durante la educación primaria. La muestra se compone de 406 niños portugueses de preescolar y del 1° ciclo de Educación Primaria, con edades comprendidas entre los 4 y los 10 años. Por medio de modelo completo de ecuaciones estructurales, se observa que la variable latente familia (nivel de escolaridad y nivel socioeconómico) y la variable latente escuela (comunidad y tipo de escuela) tienen un impacto significativo en el rendimiento académico. No obstante, solo la familia presenta un impacto significativo en el desempeño cognitivo. Estos resultados sugieren que el impacto de la escuela en el cociente de inteligencia no es tan relevante en los primeros años o niveles escolares, donde la familia presenta mayor explicación de la varianza.