Résumé Un important problème d'environnement particulièrement à l'ordre du jour au Brésil et en Bolivie concerne la contamination du milieu aquati-que par le mercure, utilisé pour extraire l'or par amalgamation. Cette etude présente un transect longitudinal des concentrations en mercure dans les eaux de surface depuis les sous-bassins andins jusqu'à l'Amazone, à Obidos. La combinaison de techniques "ultra-propres" de prélèvement et de stockage des échantillons avec la spectrophotométrie de fluorescence atomique permet de présenter des résultats fiables dans les phases dissoute et particulate des eaux et donc de corriger les valeurs récemment publiées par d'autres auteurs. Trois grandes zones sont mises en évidence : les sources andines, avec des teneurs inférieures à 2 ng Hg 1', le bassin du Madeira, dans la plaine amazonienne, avec une moyenne de 6.5 +1.3 ng Hg l" 1 , et l'Amazone, de sa confluence avec le Madeira, à Obidos avec une moyenne beaucoup plus élevée, de 18.2 ±1.1 ng Hg l" 1 . Le Madeira, avec un flux en basses eaux de 17.06 kg Hg day" 1 , contribue à 6% dans les apports totaux par l'Amazone à Obidos, la participation des Andes boliviennes n'en représentant que 2%o.