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Canadian Science Publishing, Genome, 1(49), p. 17-29, 2006

DOI: 10.1139/g05-081

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Linkage and mapping of resistance genes toXanthomonas axonopodispv.passifloraein yellow passion fruit

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Abstract

The cultivated passion fruit (Passiflora edulis f. flavicarpa) is a cross-pollinated species native to South America. In the current study, a segregating F1 population derived from a single cross between the clones IAPAR-06 and IAPAR-123 was used to construct AFLP-based linkage maps and to map resistance genes to bacterial spot caused by Xanthomonas axonopodis pv. passiflorae. Linkage analysis was performed by the 2-way pseudo-testcross mapping method using markers that segregated in a 1:1 ratio. The IAPAR-06 linkage map was constructed using 115 markers, 112 of which were allocated to 9 linkage groups (LG) covering 790.2 cM. The map of IAPAR-123 was constructed using 140 markers, 138 of which were allocated to 9 LG covering 488.9 cM. In both maps, clusters of markers were detected, indicating that the AFLP markers were not distributed at random. Bacterial resistance was assessed by measuring the diseased leaf area after wound-inoculating the leaves of F1 plants. Quantitative resistance loci (QRLs) mapping was carried out by composite interval mapping and 1 QRL was detected, which explained 15.8% of the total phenotypic variation. The possibility of considering these data for marker-assisted selection in passion fruit breeding programs is discussed.Key words: Passiflora, linkage map, bacterial leaf spot, quantitative resistance loci.Le fruit de la passion (Passiflora edulis f. flavicarpa) est une espèce allogame originaire d'Amérique du Sud. Dans le présent travail, une population F1 en ségrégation, dérivée du croisement simple entre les clones IAPAR-06 et IAPAR-123, a été employée pour produire des cartes génétiques peuplées de marqueurs AFLP et pour localiser des gènes de résistance à la bactériose du fruit de la passion causée par le Xanthomonas axonopodis pv. passiflorae. Une analyse de liaison génétique a été réalisée en faisant appel à la méthode du pseudo-testcross à deux voies avec les marqueurs montrant une ségrégation 1 : 1. La carte du clone IAPAR-06 a été assemblée avec 115 marqueurs, dont 112 ont été assignés à neuf groupes de liaison (LG) totalisant 790,4 cM. La carte du clone IAPAR-123 compte 140 marqueurs dont 138 ont été assignés à neuf LG couvrant 488,9 cM. Dans les deux cartes, des amas de marqueurs ont été observés, ce qui indique que les marqueurs AFLP ne sont pas distribués aléatoirement. La résistance bactérienne a été évaluée en mesurant la surface foliaire affectée après inoculation mécanique de feuilles des plantes F1. La cartographie des locus de résistance quantitative (QRL) a été effectuée par cartographie composite et un QRL a été détecté, lequel expliquait 15,8 % de la variation phénotypique totale. Les auteurs discutent de la possibilité d'utiliser ces données pour la sélection assistée en amélioration génétique du fruit de la passion.Mots clés : Passiflora, carte génétique, bactériose du fruit de la passion, locus de résistance quantitative.[Traduit par la Rédaction]