Os efeitos da atividade física (AF) representam uma proteção para o sistema cardiovascular e podem estar associadas às medidas antropométricas. Assim, o objetivo do estudo foi caracterizar as categorias de AF de funcionários de uma Universidade e comparar e associar com as variáveis antropométricas. Avaliou-se 311 funcionários divididos em três grupos: docente (n = 136), técnico administrativo (tec/adm) (n = 110) e operacional (n = 65). Os mesmos foram visitados no próprio local de trabalho e coletou-se o peso, a altura e a circunferência abdominal. As categorias de AF foram avaliadas pelo inventário de Baecke aplicado em forma de entrevista. A comparação das categorias de AF e das variáveis antropométricas entre os grupos de funcionários foi realizada por meio de análise de variância (ANOVA ONE-WAY) seguida da aplicação do teste de Tukey para dados com distribuição normal ou teste de Kruskal-Wallys seguido da aplicação do teste de Dunn para dados com distribuição não normal. Para análise da chance dos grupos ativo e sedentário apresentarem obesidade e risco cardiovascular foi utilizado o teste de Odds Ratio com intervalo de confiança de 95%. Os resultados mostram que o grupo docente apresentou menores escores para AF ocupacional (2,20 ± 0,44; p = 0,0042) e de locomoção (2,10 ± 0,54; p = 0,0761), enquanto o grupo tec/adm para AF total (6,35 ± 1,58; p = 0,0012) e operacional para AF de tempo livre (2,03 ± 0,95; p = 0,0111). Encontraram-se maiores valores antropométricos para o grupo operacional (índice massa corporal: p = 0,0045; circunferência abdominal: p = 0,0111) e não houve associação entre os níveis de AF e as variáveis antropométricas (p > 0,05). Assim, conclui-se que existe diferença entre categorias de AF e variáveis antropométricas dos grupos estudados. Não houve associação significante entre as variáveis, porém os sedentários apresentaram mais chance de serem obesos e terem risco cardiovascular aumentado.