Astyanax paranae Eigenmann, 1914 é um pequeno caracídeo conhecido como lambari-do-rabo-vermelho, ocorrendo em vários rios das sub-bacias do alto rio Paraná. Tendo em vista que as características ambientais como disponibilidade de recursos, diversidade de habitats entre outras podem selecionar atributos específicos possibilitando diferenciações morfológicas, testamos a hipótese de que ambientes diferentes podem influenciar características ecomorfológicas distintas entre as populações. Analisamos a ecomorfologia de Astyanax aff. paranae oriundos de três córregos localizados no município de Apucarana pertencentes a diferentes bacias hidrográficas: córregos Jurema (bacia do rio Pirapó), Biguaçú (bacia do rio Ivaí) e Japira (bacia do rio Tibagi). Para testar as diferenças foram utilizados 15 exemplares de A. aff. paranae de cada população, sendo tomadas 26 medidas morfométricas e calculadas seis áreas, de maneira que foram calculados 22 índices ecomorfológicos. Para evidenciar diferenças ecomorfológicas entre os espécimes foram realizados Análises de Variáveis Canônicas (AVC) e um teste “post hoc” de comparações pareadas de Hotelling. Na análise de comparações pareadas entre as populações de A. aff. paranae nos córregos amostrados, o córrego Japira apresentou diferenças estatísticas significantes em relação ao córrego Biguaçú. As diferenças ecomorfológicas entre as populações do córrego Biguaçu e as dos córregos Jurema e Japira podem estar relacionadas com as características biogeográficas de cada bacia. Além disso, as particularidades de cada ambiente, como as interações bióticas e abióticas provida pela qualidade ambiental nos córregos Jurema e Japira podem ser influências, mesmo que de maneira discreta, frente às peculiaridades ecológicas de cada organismo. Palavras-chave: córregos, rio Ivaí, rio Paranapanema, isolamento geográfico, qualidade ambiental. DOI: http://dx.doi.org/10.18561/2179-5746/biotaamazonia.v5n3p44-49