Resumen Objetivo: describir el proceso de implementación subnacional de la certificación de eliminación de la transmisión vertical (TV) de sífilis y/o VIH, barreras, oportunidades y desafíos. Métodos: en 2022, se evaluaron indicadores del último año completo para la meta de impacto y de los dos últimos años para las de proceso en los sistemas de información; se analizaron informes descriptivos y se reconocieron acciones de cuatro ejes, según las recomendaciones de la OPS/OMS. Resultados: se certificaron 43 municipios ≥ 100.000 mil habitantes, cubriendo 24,6 millones de habitantes; un municipio logró la doble eliminación (VIH-sífilis), 28 la eliminación del VIH y 10 sellos plata; para sífilis, hubo una eliminación, 4 sellos oro, 13 plata y 4 bronce; las regiones Sudeste y Sur obtuvieron más certificaciones. Conclusión: barreras y desafíos fueron superados mediante la colaboración tripartita; la experiencia permitió la integración de la vigilancia con la atención y la cualificación de acciones para la prevención de la TV.