O consumo indiscriminado de plantas medicinais pela população pode ocasionar efeitos negativos, uma vez que, certas substâncias presentes podem ser tóxicas. Espécies de Cróton L. são frequentemente utilizadas na forma de infusões e chás na medicina tradicional. Objetivou-se avaliar o potencial mutagênico, genotóxico e citotóxico de frações do extrato de Cróton spp. (Euphorbiaceae). Os testes ocorreram em células meristemáticas de Allium cepa tratadas com diferentes concentrações das frações. Na análise dos resultados foram observados potenciais citotóxicos e mutagênicos em Cróton betaceus e Cróton lundianus. O fracionamento demonstrou efeitos tóxicos nas espécies, com o aparecimento de aberrações cromossômicas e nucleares como: micronúcleos, quebras cromossômicas e brotos, pontes, anáfases multipolares, aderências cromossômicas revelando possíveis efeitos nocivos ao ser humano, bem como reforçando e elucidando que o uso de plantas medicinais deve ser realizado de forma consciente e responsável pois algumas plantas possuem potenciais de intoxicação e devem, portanto, serem consumidas com a atenção e cuidado.