Introdução: O Câncer do Colo do Útero (CCU) é o segundo tipo de câncer mais comum na população feminina. O Papilomavírus Humano (HPV) é considerado fator de elevado potencial oncogênico para desenvolvimento do CCU. A imunização contra o HPV é uma das intervenções em saúde públicas mais econômicas, até o momento. Com o surgimento da pandemia da COVID-19, essa prevenção vem sendo afetada. Para compreender a gravidade e as possíveis conseqüências negativas desta pandemia sobre as interrupções dos serviços de imunização na região do Xingu, é necessário fazer um balanço das tendências da cobertura de imunização antes e durante a pandemia. Objetivo: Analisar o impacto da pandemia por COVID-19 na cobertura vacinal anti-HPV em crianças e adolescentes de 9 a 14 anos, na região do Xingu, com ênfase no município de Altamira-Pará. Métodos: Trata-se de um estudo descritivo, ecológico de série temporal, realizado com dados secundários da cobertura vacinal anti-HPV. Resultados: O estudo identificou que, na região do Xingu, houve redução na imunização em seis dos nove municípios da referida região, durante a pandemia por COVID-19. Conclusão: Em 2019 a região do Xingu não alcançou a meta vacinal preconizada. Em 2020, durante a pandemia, a situação foi agravada ainda mais. Ressalta-se que a vacinação contra o HPV impacta em longo prazo na redução de incidência da morbimortalidade de CCU. Problema de saúde pública o qual encontra-se dentro das metas de controle das doenças crônicas não transmissíveis.