Os Sistemas Integrados de Produção Agropecuária vêm crescendo no Brasil como alternativa mais sustentável de produção de grãos bem como recuperação de áreas de pastagem em degradação. No entanto, têm-se poucas informações sobre a dinâmica de nematoides nesse sistema, os quais podem acarretar perdas de produtividade. Objetivou-se assim, verificar a dinâmica de fitonematoides durante a implantação do sistema integrado de produção com milho. O experimento foi conduzido em Iporá – GO, avaliando-se três tratamentos (épocas de plantio do milho) durante 14 meses de avaliação. A população e produção de matéria seca dos três componentes foram mensurados. Os tratamentos foram analisados por modelos mistos, efeitos fixos e aleatórios utilizados e as médias comparadas usando o ajuste de Tukey. Para avaliação da relação entre as variáveis, foram realizadas análises de correlação e componentes principais (PCA). Verificou-se que o aumento populacional de fitonematoides do gênero Pratylenchus e Criconemella está relacionado com as épocas do ano e com umidade do solo, destacando-se para a temperatura mais elevada. Não se observou correlação significativa entre produção de grãos e população de fitonematoides. A população de fitonematoides não diferiu entre a área em que foi implantado o SIPA em relação a área de pastagem em degradação e de mata nativa (Cerrado). A implantação do SIPA não afetou a população de fitonematoides e estes não afetaram a produção do milho.