A irrigação com um manejo inadequado pode alterar a qualidade dos recursos hídricos, diante desta informação, o objetivo desta pesquisa foi avaliar o impacto da irrigação, principalmente da rizicultura, na qualidade das águas superficiais do Perímetro de Irrigação de Cotinguiba/Pindoba, localizado na região hidrográfica do Baixo São Francisco Sergipano. Nesta pesquisa foram avaliados 22 parâmetros da qualidade da água (alcalinidade total, cálcio, cloretos, clorofila-a, coliformes termotolerantes, coliformes totais, condutividade elétrica, cor aparente, DBO, DQO, ferro dissolvido, ferro total, fósforo total, magnésio, nitrato, oxigênio dissolvido, pH, sólidos em suspensão, sólidos dissolvidos, sólidos totais, temperatura e turbidez), obtidos de dados secundários do programa de monitoramento da qualidade da água disponibilizados pela Companhia de Desenvolvimento do Vale do São Francisco e Parnaíba (CODEVASF), através dos relatórios das campanhas de monitoramento realizadas nos anos de 2006, 2013 e 2014, e comparados com os valores estabelecidos pela resolução CONAMA 357/2005. As concentrações de fósforo total e de cor não atenderam os padrões da classe II de água doce. O valor máximo de condutividade elétrica encontrado neste estudo apresenta restrições leves a moderadas para o uso da água na irrigação. A análise da qualidade da água permitiu evidenciar que o aporte de águas drenadas do Perímetro Cotinguiba/Pindoba contribuiu com o aumento da concentração de algumas variáveis, por isso, a importância de manter um plano de gestão ambiental para mitigar os impactos.