Objetivo: Caracterizar a microbiota de feridas complexas e a resistência antimicrobiana dos microrganismos encontrados. Métodos: Estudo transversal de cunho observacional e dissertativo, realizado a partir dos resultados de culturas microbiológicas de pacientes em acompanhamento ambulatorial para tratamento de feridas complexas. Estudo aprovado sob parecer CAAE número 93044418.6.0000.5013. Resultados: Foram analisados 110 exames, coletados a partir de lesões do tipo vasculogênica, diabética, lesão por pressão, cirúrgica, oncológica, aguda, antraz, síndrome de fournier e úlcera de marjolin. Foram identificadas 22 espécies de bactérias, sendo 18 Gram-negativas e 4 Gram-positivas, predominando as espécies Pseudomonas aeruginosas, Proteus mirabilis e Staphylococcus aureus. Todos os microrganismos identificados apresentaram resistências a, pelo menos, um antimicrobiano, sendo a espécie P. mirabilis com resistência a um maior número de antibióticos. Conclusão: Esse estudo aponta que a microbiota de feridas complexas é predominantemente composta por microrganismos Gram-negativos, destaca-se a espécie P. aeruginosa. A resistência antimicrobiana foi detectada em todos os microrganismos encontrados.