Objetivo: Conhecer a percepção dos enfermeiros que atuam em uma unidade de transplantes sobre os desafios de sua atuação ante a COVID-19.Método: Estudo descritivo e exploratório, com abordagem qualitativa, desenvolvido em uma unidade de transplantes de um hospital referência do Ceará,entre março e junho de 2020, por meio de entrevista. Os dados foram analisados pelo software Interface de R pour les Analyses Multidimensionnelles deTextes et de Questionnaires (IRAMUTEQ). Posteriormente, foi realizada a análise fatorial por correspondência (AFC) e gerada uma nuvem de palavraspara a qual foram consideradas as evocações que apareceram com maior frequência. Resultados: Participaram do estudo 14 enfermeiros, a maioria dosexo feminino. O conteúdo analisado foi categorizado em três classes: organização do fluxo de atendimento de casos suspeitos, equipamento de proteçãoindividual no contexto da pandemia da COVID-19, o emocional ante a pandemia. Conclusão: Constatou-se que os enfermeiros sofrem ante as fragilidadesrelacionadas ao momento vivenciado, pois estão sendo cotidianamente desafiados a se adaptarem às mudanças em suas rotinas de trabalho.