Objetivo: identificar os subtipos do HIV-1, avaliar a presença de mutações de resistência aos antirretrovirais (DRM) e estimar o nível de resistência das cepas mutantes detectadas em mulheres gestantes atendidas na maternidade de referência no Piauí, nordeste do Brasil. Metodologia: Das 873 mulheres gestantes, 17 infectadas pelo HIV-1 foram selecionadas para participar deste estudo. A genotipagem do HIV-1 foi realizada usando sequenciamento de nucleotídeos seguida de análises filogenéticas para determinar o subtipo viral, incluindo a identificação usando ferramenta on-line COMET. DRM foram definidas usando o programa Calibrated Population Resistance Tool. Análises adicionais também foram realizadas para verificar a resistência aos medicamentos no pré-tratamento usando o Programa Stanford HIVdb. Resultados: O subtipo B foi detectado em todas as gestantes infectadas pelo HIV-1. A prevalência de DRM foi 11.8%. As mutações L90M e K103N foram identificadas, sendo estimada resistência alta (nelfinavir e nevirapine) e intermediária (indinavir e saquinavir) a diferentes antirretrovirais. Conclusão: Este estudo identificou importantes informações genéticas do HIV-1 em gestantes no Piauí, as quais podem auxiliar no direcionamento de medidas de controle e de prevenção dessa infecção viral.