As atividades antrópicas são uma das principais causas da poluição dos ambientes aquáticos, pois favorece o fenômeno da eutrofização. Esse processo é caracterizado pelo crescimento elevado do fitoplâncton, considerado como bioindicador da qualidade ambiental desses ambientes. Este trabalho objetiva investigar a qualidade ambiental em um trecho urbano do rio Jaguaribe por meio da comunidade fitoplanctônica e das características químicas da água. As amostragens ocorreram durante o período chuvoso (Abril/2018) e seco (Julho/2018), em cinco pontos distribuídos ao longo do trecho urbanizado do rio. O fitoplâncton foi coletado através de uma rede coletora de plâncton. Adicionalmente, foram analisados os compostos nitrogenados e fosfatados da água. As maiores concentrações dos compostos nitrogenados e fosfatados ocorreram no período chuvoso, assim como a maior riqueza de espécies, resultado provavelmente influenciado pelo maior aporte de nutrientes decorrente da entrada de material alóctone no rio. As análises químicas revelaram, uma baixa qualidade das águas do rio Jaguaribe quando comparados com os padrões estabelecidos pelo CONAMA, o que foi corroborado pela presença de várias espécies de clorofíceas, cianofíceas e diatomáceas comuns em ambientes sob elevado nível de poluição. Dessa forma, faz-se necessário realizar um monitoramento periódico da qualidade da água devido à grande importância econômica, social e ecológica que o rio Jaguaribe possui para toda a região.