Se comparó la diversidad de anfibios entre selva y vegetación secundaria, incorporando la distintividad taxonómica en los análisis de diversidad. Para el muestreo de los individuos se establecieron cuatro transectos de 200 m de largo en ambos ecosistemas. Los muestreos se realizaron una vez al mes, durante seis meses, con búsquedas diurnas y nocturnas. Se registraron un total de 424 individuos de nueve familias, pertenecientes a 19 especies de 14 géneros, y por primera vez se reporta Bolitoglossa veracrucis para el estado de Tabasco. En ambos ecosistemas se registró una riqueza de 14 especies, siendo la selva la que obtuvo la mayor abundancia con 269 individuos y la menor en vegetación secundaria con 155. El índice de diversidad verdadera de orden 1D y 2D, determinó que la vegetación secundaria (6.28 y 4.61) es más diversa que la selva (3.43 y 1.90), con una similitud de especies del 64%. El índice de diversidad taxonómica (Δ) y el índice distintividad taxonómica (Δ*), mostraron los mayores valores en vegetación secundaria (Δ=2.36, Δ*=2.99) y los menores en selva (Δ=1.07, Δ*=2.42). Sin embargo, el índice de distintividad taxonómica promedio (Δ+), mostró valores similares entre los ecosistemas. La incorporación de la distintividad taxonómica en los estudios de diversidad permite evaluar más allá del número de especies, tomando en cuenta las distancias y relaciones taxonómicas, las cuales podrían ser un reflejo de la diversidad funcional de una comunidad.