本計畫擬研究有機廢棄物以厭氧消化處理產生甲烷，作為生質能源發電或其它利用。另為考量有機廢棄物生質能源處理之多元化面向，亦將進行微生物燃料電池，利用微生物分解有機廢棄物以產生電力使用。 本研究之另一實驗為以厭氧-缺氧-缺氧-好氧-好氧-好氧活性污泥法(A2O程序)，進行生活污水中有機物與氮及磷之去除。活性污泥法之第五槽好氧槽，與微生物燃料電池結合，作為微生燃料電池之陰極槽，除可作為電子接受外，亦可培養微藻，吸收生活污水中之氮磷，以萃取生質柴油作為能源用。